V javnem sektorju sta glede energije pomembni dve področji: načrtovanje in izvajanje trajnostnega energetskega razvoja lokalnih skupnosti z vidika oskrbe z energijo in smotrno ravnanje z energijo v javnih stavbah. V javnem sektorju obstajajo znatni potenciali tako za povečanje energetske učinkovitosti kot tudi za izrabo obnovljivih virov energije in soproizvodnjo električne energije in toplote.  

Učinkovito in gospodarno ravnanje z energijo v javnem sektorju Agencija podpira z subvencioniranjem energetskih konceptov občin, energetskih pregledov javnih stavb in študij izvedljivost za investicije v učinkovito rabo energije in izrabo obnovljivih virov energije.  Agencija podeljuje tudi subvencije za investicije v izrabo obnovljivih virov energije. Na voljo je tudi vrsta informacijskih listov in vodnikov.